Если удалить корень чрута, то подкаталоги (к примеру, bin для postgresql9.0) в чруте не содаётся и файлы не копируются. Решением могло бы стать принудительное создание в функции Сopy структуры каталогов по указанному пути: if ! ln -nf $verbose "$src" "$dst" 2>/dev/null; then mkdir -p "$(dirname "$dst")" $cp -p $verbose $args "$src" "$dst" fi
Никогда раньше Copy() и CopyLibs() структуру каталогов не создавали. Вопрос в том, какие права доступа должны быть у создаваемых каталогов.