В Deluge нельзя настроить куда помещать скачанные файлы, откуда загружать торенты и.т.д. То есть все что находится во вкладке Настройка-Загрузки. Настройки директорий не сохраняются. Проверенно на двух машинах. Установленный с altlinux-7.0.0_beta-20130415-kdesktop-i586-ru-install-dvd5.iso и обновленный до p7. Удаление каталога .config/deluge и перезапуск программы ситуацию не изменяет.
На Sisyphus с последующим бэкпортированием.
Судя по всему это баг в Gtk. Баг в трекере deluge: http://dev.deluge-torrent.org/ticket/2169 Баг в трекере gnome: https://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=691040
На данный момент на p7 я больше такого бага не наблюдаю.
Все верно только что проверил. К сожалению deluge давненько не пользовался.