У userpasswd-gnome и userpasswd-gtk не отображается значок программы на панели в сеансах на wayland. Причина в том, что нет desktop-файла, соответствующего ему по имени. Вариант1. Самое простое оставить один интерфейс на gtk4 и выкинуть альтернативу. Вариант2. Запаковать фейковый desktop файл. Вариант3. Каким-то образом задать имя desktop-файла в приложении.